Tenta saber se com essas alterações houve ou não algum tipo de alteração quer em termos de dimensões dos tubos ou outros factores que influenciem o funcionamento do sistema, é que substituir por peças iguas, a única coisa que vai descartar, é defeito de fabrico de alguma peça. Mas se ficou igual ou pior, já não se pode considerar defeito de fabrico mas defeito na concepção do sistema, e ai é necessário alterar o sistema.Pelo que relatas parece-me que está a ser exercida demasiada pressão, o que causa a dureza e as vibrações. A solução seria colocar o sistema mais "leve", ou seja menos força exercida no pedal da embraiagem, talvez com uma bomba diferente de menor diâmetro mas com um curso maior.